Одна из крупнейших представительниц современного авторского неигрового кино. Создала кинопортреты выдающихся мастеров отечественного искусства, снятые методом длительного наблюдения за творческим процессом. Фильмы Меркель "Вечное движение" и "О кино, кино!" до сих пор остаются непревзойденными образцами, открытого ею жанра. Постепенно перешла к поискам неигровых форм, передающих зрителю образы утраченного времени, где достигла редкой психологической глубины и впечатляющего драматизма в рассказах о судьбах Валентины Гагариной ("Жена космонавта"), балерины Ольги Спесивцевой ("Божественная Жизель"), физика Льва Ландау ("Жизнь после смерти"), княгини Екатерины Дашковой ("Стас-дама при императорском портрете").